меню
26-я Международная специализированная выставка
Международный деловой медико-фармацевтический форум
2-5 декабря 2019, Москва, ЦВК «Экспоцентр»

02.09.2011

Оксид графена расскажет о взаимодействии белок-белок

Оксид графена расскажет о взаимодействии белок-белок

Аналитическая система на основе оксида графена может стать для химиков недорогим методом для определения взаимодействий белок-белок. Для разработки новых кандидатов в лекарства на основе пептидов исследователям зачастую необходимо определять, каким образом связанный с заболеванием белок взаимодействует с библиотекой небольших по размеру пептидов.

Руководитель исследования Чун Хуа Лю (Chun-Hua Lu) из Университета Фучжоу отмечает, что самая сложная задача, которую приходится решать в связи с этим — разработка легко измеряемого сигнала, свидетельствующего о взаимодействии белков с пептидами. Обычно для этого применяется спектроскопия флуоресцентного резонансного переноса энергии [fluorescence resonance energy transfer (FRET) spectroscopy], с помощью которой можно определить расстояние между связанными с белками флуоресцирующими белками, однако весьма часто белку перед связыванием приходится изменять свою форму. Для того, чтобы изучать белки, форма которых при связывании с пептидами не изменяется.

Исследователи привили пирен к одной из концевых групп пептида и измерили его флуоресценцию с помощью спектрометра. Затем меченый пептид смешали с оксидом графена, с которым взаимодействовал пирен. Оксид графена гасит флуоресцентный сигнал пептида, несущего на себе пиреновый фрагмент при параллельном ориентировании пирена и плоской поверхности оксида графена. На закоючительном этапе исследователи добавляли в систему изучаемый белок и, если тот связывался с пептидом, меченый пептид отрывался от поверхности графена и флуоресценция возобновлялась. Исследователи протестировали свой метод на хорошо известной системе — пептиде, который при связывании с антителом, вырабатывающимся организмом человека является индикатором ВИЧ-инфекции. Было обнаружено, что флуоресценция пирена наблюдается при концентрации пирена, большей, чем 200 пикомоль/л.

Для дальнейшей проверки метода исследователи использовали антитела непосредственно в образцах слюны и сыворотки, содержащих молекулы, способные помешать взаимодействию протеин-пептид. Однако и в присутствии дополнительных химических веществ, способных повлиять на ход анализа, пределы обнаружения составляли 2 наномоль/л для образцов, полученных из слюны и 5 наномоль/л для образцов, полученных из сыворотки, что не хуже чувствительности известных методов.

Кевин Плакско (Kevin Plaxco) из Университета Калифорнии говорит о методе, разработанном в группе Лю, со сдержанным оптимизмом, заявляя, что, хотя исследователи из Фучжоу и продемонстрировали возможности метода на нескольких парах белок-пептид, для доказательства того, что метод может применяться в более широких рамках, требуются дальнейшие исследования. Источник: Anal. Chem., 2011, DOI: 10.1021/ac200617k. Оксид графена гасит флуоресценцию пептида, меченого пиреновыми фрагментами (звездочка с зеленой цепью) когда пиреновый фрагмент сближается с углеродным слоем (центральный фрагмент рисунка). Однако, когда с пептидом связывается белок, пептид отрывается от слоя оксида графена и флуоресценция возобновляется (розовая звездочка на правом фрагменте). (Рисунок из Anal. Chem., 2011, DOI: 10.1021/ac200617k).

Источник http://www.pharmcluster.ru

См.также: Мебель для аптек | Медицинские выставки | Гомеопатия | Аптека | Лекарственные средства | БАДы | Лечебная косметика

Вернуться к списку новостей